Dies ist der Befehl garniere, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
garnier – Prognostiziert die Sekundärstruktur von Proteinen mithilfe der GOR-Methode
ZUSAMMENFASSUNG
Garnierung -Reihenfolge Fortsetzung -idc ganze Zahl -outfile berichten
Garnierung -Hilfe
BESCHREIBUNG
Garnierung ist ein Kommandozeilenprogramm von EMBOSS („the European Molecular Biology Open
Software-Suite“). Es ist Teil der Befehlsgruppe(n) "Protein:2D-Struktur".
OPTIONAL
Eingang Abschnitt
-Reihenfolge Fortsetzung
Erweitert Abschnitt
-idc ganze Zahl
GOR erwähnt dies in ihrem Artikel, wenn Sie etwas über die Sekundärstruktur wissen
Durch den Gehalt des Proteins, das Sie analysieren, können Sie bessere Vorhersagen treffen. 'idc' ist ein
Index in eine Reihe von Arrays, dharr[] und dsarr[], die „Entscheidungskonstanten“ bereitstellen.
(dch, dcs), das sind Offsets, die auf die Gewichte für die Helix und das Blatt angewendet werden
(erweitern) Begriffe. Also, idc=0 besagt, dass die Entscheidungskonstanten-Offsets nicht verwendet werden sollen, und idc=1 bis 6
gibt an, dass verschiedene Kombinationen von dch,dcs-Offsets verwendet werden sollten.
Ausgang Abschnitt
-outfile berichten
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