gdcm2vtk - Online in der Cloud

PROGRAMM:

NAME/FUNKTION

gdcm2vtk - Konvertiert eine von VTK unterstützte Datei in DICOM.

ZUSAMMENFASSUNG

gdcm2vtk [Optionen] Dateieingang Dateiausgang

BESCHREIBUNG

Das gdcm2vtk nimmt als Eingabe jede Datei, die von VTK unterstützt wird (einschließlich DICOM-Datei) und wird
als Ausgabe eine DICOM-Datei generieren.

PARAMETER

file-in Eingabedateiname (DICOM oder VTK unterstützt)

file-out Ausgabedateiname (DICOM oder VTK unterstützt)

OPTIONAL

spezifisch Optionen
--force-rescale Neuskalierung erzwingen.
--force-spaced Kraftabstand.
--palette-color, wenn unterstützt, erzeugt eine PALETTE COLOR-Datei.
--argb, wenn unterstützt, eine ARGB-Datei generieren.
--compress wenn unterstützt erzeugt eine komprimierte Datei.
--use-vtkdicom Verwenden Sie vtkDICOMImageReader (anstelle von GDCM).
--modality setzt die Modalität.
--lower-left setzt unten links.
--shift set verschiebung.
--scale Maßstab setzen.
--compress Satzkomprimierung (MetaIO).
-T --study-uid Studien-UID.
-S --series-uid Serien-UID.
--root-uid Root-UID.

Werkzeugen Optionen
-J --jpeg Bild in JPEG komprimieren.
-K --j2k Bild in j2k komprimieren.
-L --jpegls Bild in jpeg-ls komprimieren.
-R --rle Bild in rle komprimieren (nur verlustfrei).

General Optionen
-h - Hilfe
Diesen Hilfetext drucken und beenden

-v --version
Versionsinformationen drucken und beenden

-V --ausführlich
ausführlicher Modus (Warnung+Fehler).

-W --Warnung
Warnmodus, Warninformationen drucken

-E --Fehler
Fehlermodus, Fehlerinformationen drucken

-D --debuggen
Debug-Modus, Debug-Informationen drucken

Umwelt Variable
GDCM_ROOT_UID Root-UID

BESCHREIBUNG

Konvertieren Sie eine von VTK unterstützte Datei in DICOM.

Typische Verwendung ist:

$ gdcm2vtk Eingabedatei output.dcm

Es verwendet den internen Werksmechanismus von VTK, um eine Datei zu erkennen (CanRead-Funktion). Sehen
VTK unterstützte Datei hier:

Welche Bilddateiformate kann VTK lesen und schreiben? http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ#What_image_file_formats_can_VTK_read_and_write.3F

Wenn Ihre Eingabedatei 4 Komponenten enthält, wird die 4. Komposition (Alpha) aus der Ausgabe entfernt
Datei, da DICOM keine Alpha-Komponente mehr unterstützt (siehe Option –argb).

Besondere Sorgfalt wurde auf das folgende Dateiformat gelegt:

1. DICOM: Direction Cosinus und vtkMedicalImageInformation werden an den Ausgang übergeben
2. BMP: Die Datei kann mit einer Lookup Table gespeichert werden (siehe --palette-color)
3. GE Signa: vtkMedicalImageProperties wird an die Ausgabe übergeben
4. MINC: Direction Cosinus wird an den Ausgang übergeben
5. TIFF: vtkTIFFReader ist derzeit in VTK in einem schlechten Zustand (anderes Verhalten in VTK 5.2 und git/master). Verwenden Sie es nur, wenn Sie wissen, was Sie tun.

KONVERTIEREN MetaImage (Mh, ähm)
$ gdcm2vtk Eingabedatei output.mha

Dieser Befehl konvertiert die DICOM-Eingabedatei: inputfile in eine MetaImage .mha-Datei. Dasselbe
geht für .mhd-Datei.

KONVERTIEREN MHA/MHD
$ gdcm2vtk Eingabedatei output.mha

or

$ gdcm2vtk Eingabedatei output.mhd

Dieser Befehl konvertiert die DICOM-Eingabedatei: inputfile in eine MetaImageData .mha/.mhd
Datei.

KONVERTIEREN VTI
$ gdcm2vtk Eingabedatei output.vti

Dieser Befehl konvertiert die DICOM-Eingabedatei: inputfile in eine XML VTK ImageData .vti
Datei.

KONVERTIEREN VTK
$ gdcm2vtk Eingabedatei output.vtk

Dieser Befehl konvertiert die DICOM-Eingabedatei: inputfile in eine alte VTK Structured
PointSets .vtk-Datei.

KONVERTIEREN DICOM

$ gdcm2vtk Eingabe.dcm Ausgabe.dcm

vtkGDCMImageReader wird zum Einlesen einer DICOM-Datei verwendet, nicht der Standard
vtkDICOMImageReader. Siehe Option –use-vtkdicom, um vtkDICOMImageReader zu verwenden.

RUNDFAHRT DICOM TO MHD TO DICOM

$ gdcm2vtk Eingabe_ybr.dcm Ausgabe.mhd
$ gdcm2vtk --modality US --imageformat 7 Ausgabe.mhd Ausgabe.dcm

Der obige Ref-Abschnitt zeigt, wie ein DICOM mithilfe der photometrischen Interpretation von . konvertiert wird
YBR_FULL (oder sogar YBR_FULL_422 ist verlustbehaftet) in ein anderes Dateiformat: MetaImage (mhd). Schon seit
Dieses Dateiformat kann keinen Farbraum verarbeiten, wir müssen es explizit mit dem
–imageformat-Befehlszeilenoption. Die Befehlszeilenoption –modality ist dabei erforderlich
Fall, da die Standardfamilie der sekundären Bildspeicherklassen für Captures YBR nicht zulässt
Photometrische Interpretation.

GDCM2VTK ANMERKUNG

WICHTIGER HINWEIS: Die interne VTK-Struktur wird aus dem DICOM-Eingang gefüllt und dann
an den Ausgabe-DICOM-Writer übergeben. Einige Informationen können während der Konvertierung verloren gehen
DICOM zu VTK zu DICOM. Diese Option wird hauptsächlich verwendet, um die
vtkGDCMImageReader/vtkGDCMImageWriter-Kombination.

WICHTIGER HINWEIS: Beim Konvertieren aus einem verlustbehafteten Format wie JPEG werden die Informationen von
Verlustbereitschaft ist wichtig. Das Ausgabe-DICOM enthält das erforderliche verlustbehaftete Bild
Komprimierungsattribut, das angibt, dass das Bild irgendwo entlang des Bildes verlustbehaftet komprimiert wurde
Pipeline. Siehe auch gdcmimg (besserer Umgang mit JPEG im Allgemeinen).

WICHTIGER HINWEIS: Bei Verwendung von –use-vtkdicom wird die Ausgabe-DICOM-Datei immer als
MR-Bildspeicherung, da diese Informationen nicht vom Lesegerät selbst verfügbar sind. Dies ermöglicht
die Bildausrichtung (Patient) richtig einstellen.

Verwenden Sie gdcm2vtk online mit den onworks.net-Diensten