Dies ist der Befehl glam2scan, der im kostenlosen OnWorks-Hosting-Anbieter über eine unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
glam2scan - findet ein GLAM2-Motiv in einer Datenbank
ZUSAMMENFASSUNG
glam2scan [Optionen] Alphabet mein_motiv.glam2 my_seqs.fa
Ein anderes Alphabet als p or n wird als Name einer Alphabetdatei interpretiert.
BESCHREIBUNG
glam2scan findet in einer Sequenzdatenbank Übereinstimmungen mit einem von . entdeckten Motiv Glam2. Jeder
match erhält eine Punktzahl, die angibt, wie gut es zum Motiv passt.
OPTIONAL (URSPRÜNGLICH DIE EINSTELLUNGEN)
-h
Alle Optionen und ihre Standardeinstellungen anzeigen.
-o
Ausgabedatei (stdout).
-n
Anzahl der zu meldenden Ausrichtungen (25).
-2
Untersuchen Sie beide Stränge - Vorwärts- und Rückwärtskomplement.
-D
Pseudoanzahl löschen (0.1).
-E
Pseudoanzahl ohne Löschung (2.0).
-I
Einfügungs-Pseudozahl (0.02).
-J
Pseudozähler ohne Einfügung (1.0).
-d
Dirichlet-Mischungsdatei.
Verwenden Sie glam2scan online mit den onworks.net-Diensten
