Dies ist der Befehl gmod_fasta2gff3.plp, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
$O – Konvertieren Sie FASTA in einfaches GFF3
ZUSAMMENFASSUNG
% $O [Optionen]
BEFEHLSZEILE OPTIONAL
--fasta_dir Verzeichnis enthält Fasta-Dateien
(Standard: ./fasta)
--gfffilename Name der zu erstellenden GFF3-Datei
(Standard: ./out.gff)
--type SO-Typ, der jeder Funktion zugewiesen werden soll
(Standard: EST)
--source Text, der in der Quellspalte angezeigt werden soll
(Standard: .)
--attributes Zusätzliche Tag=Wert-Paare, die in Spalte 9 angezeigt werden
--nosequence Unterdrückt den Abschnitt ##FASTA (d. h. nicht).
DNA-Sequenzen drucken)
BESCHREIBUNG
Dieses Skript nimmt einfach eine Sammlung von Fasta-Dateien und konvertiert sie in einfaches GFF3
Geeignet zum Laden in den Chado.
AUTOREN
Scott Cain[E-Mail geschützt] >
Copyright (c) 2006
Bei dieser Bibliothek handelt es sich um freie Software. Sie können es weitergeben und/oder unter demselben Namen ändern
Begriffe wie Perl selbst.
Verwenden Sie gmod_fasta2gff3.plp online über die Dienste von onworks.net