Dies ist der Befehl gt-encseq-decode, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
gt-encseq-decode – Kodierte Sequenzen dekodieren/extrahieren.
ZUSAMMENFASSUNG
gt Anhang dekodieren (Sequenzdatei|Indexname)
BESCHREIBUNG
-gespiegelt [ja|nein]
das umgekehrte Komplement jeder Sequenz virtuell anhängen (Standard: nein)
-verlustfrei [ja|nein]
Verlustfreies Abrufen der Originalsequenz zulassen (Standard: Nein)
ist [Schnur]
Leserichtung angeben (fwd, cpl, rev, rcl) (Standard: fwd)
-einzelne Zeichen [ja|nein]
Verwenden Sie keinen GtEncseqReader, sondern greifen Sie auf jedes Sequenzzeichen separat zu (Standard:
Nein)
-seq [Wert]
Extraktionssequenz, identifiziert durch ihre Nummer (Standard: undefiniert)
-seqrange [Anfang Ende]
Mehrere aufeinanderfolgende Sequenzen extrahieren (Standard: undefiniert)
-Ausgang [...]
Geben Sie das Ausgabeformat an (wählen Sie aus fasta|concat) (Standard: fasta)
-Angebot [Anfang Ende]
verketteter zu extrahierender Bereich (impliziert -Ausgang concat) (Standard: undefiniert)
-sepchar [Schnur]
Geben Sie das zu druckende Zeichen als SEPARATOR an (Standard: |)
-Hilfe
Hilfe für grundlegende Optionen anzeigen und beenden
-Hilfe+
Hilfe zu allen Optionen anzeigen und beenden
-Ausführung
Versionsinformationen anzeigen und beenden
REPORTING Fehler
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