Dies ist der Befehl ilink, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
ilink – GEMINI-Optimierungsverfahren, um einen lokal optimalen Wert des Theta-Vektors zu finden
von Rekombinationsfraktionen
ZUSAMMENFASSUNG
ilink [Optionen] ipedfile.dat pedfile.dat
BESCHREIBUNG
Diese Handbuchseite dokumentiert kurz die ilink Befehl. Tatsächlich ist dies eine sehr grobe Absicht
um eine Manpage bereitzustellen, da die Debian GNU/Linux-Distribution dies von jedem Programm erfordert
Habe eine Manpage. Jede Verbesserung wäre sehr dankbar.
ilink ist in der Schnellverbindung Softwarepaket.
ILINK verwendet das GEMINI-Optimierungsverfahren, um einen lokal optimalen Wert des Theta zu finden
Vektor der Rekombinationsfraktionen. Wenn Sie die von lcp erstellten Standardskripts verwenden, ist Ihr
Die anfängliche Schätzung für Theta liegt bei 1 in jeder Dimension. GEMINI bewertet jedes Theta nach seinem
Wahrscheinlichkeit, um Theta-Vektoren zu finden, die eine höhere Stammbaumwahrscheinlichkeit haben.
Die GEMINI-Prozedur verfügt über mehrere Iterationen. Jede Iteration entspricht einer Zeile von
Ausgang. Jede Iteration umfasst mehrere Likelihood-Funktionsauswertungen. Jede Iteration
hat zwei Phasen. In Phase I versucht GEMINI, das aktuell beste Theta zu verbessern. In Phase II,
GEMINI schätzt den Gradienten der Wahrscheinlichkeit in Bezug auf das aktuell beste Theta
Vektor. In der ersten Iteration bewertet Phase I nur die anfängliche Wahrscheinlichkeit
Kandidat Theta.
Wenn ILINK eine Zeile ausgibt, z. B.: maxcensor kann auf -32767 reduziert werden, ist der Vorgang abgeschlossen
die erste Wahrscheinlichkeitsfunktionsauswertung. Bei langen Läufen kann diese Tatsache zur Abschätzung genutzt werden
Laufzeit. Eine vernünftige grobe Schätzung für die Anzahl der Funktionsauswertungen ist
10*(Anzahl der Dimensionen des Theta-Vektors). Die Anzahl der Dimensionen des Theta-Vektors beträgt
in den meisten Fällen eins weniger als die Anzahl der Loci. Wenn Maletheta und Femaletheta erlaubt sind
unterscheiden (sexdif ist auf 1 gesetzt), dann verdoppelt sich die Anzahl der Dimensionen auf 2 * (Anzahl der
Orte - 1). Das Schätzen anderer Parameter (wobei Fitmodel auf „True“ gesetzt ist) kann ebenfalls zu einer Erhöhung führen
Anzahl der Dimensionen.
Um darüber zu erfahren, lesen Sie unbedingt unseren Leitfaden: ilink Es könnte nützlich sein, die Datei zu lesen
/usr/share/doc/fastlink/README.ILINK wenn Sie ein Debian GNU/Linux-System haben.
OPTIONAL
Es könnte Optionen geben, aber ich habe keine Informationen darüber gefunden. Bitte weiterleiten
alle Informationen über sie an[E-Mail geschützt] >
Nutzen Sie ilink online über die Dienste von onworks.net
