Dies ist der Befehl insdseqget, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
insdseqget – Sequenzen aus GenBank als XML-INSDSet formatieren
ZUSAMMENFASSUNG
insdseqget [-] [-d Dateinamen] [-i Dateinamen] [-m n/p/b] [-n] [-o Dateinamen] [-v]
BESCHREIBUNG
insdseqget ruft biologische Sequenzdaten von GenBank ab (gemäß einer Eingabeliste von
GI-Zugangsnummern) und druckt es als XML-INSDSet-Dokument aus.
OPTIONAL
Nachfolgend finden Sie eine Zusammenfassung der Optionen.
- Nutzungsnachricht drucken
-d Dateinamen
Name der Eingabedatei für die Datumsliste (gewünschte Zusätze, einer pro Zeile, gefolgt von einem
Leerzeile und eine Liste der erlaubten Daten, ebenfalls eines pro Zeile)
-i Dateinamen
Name der Eingabedatei für die GI-Liste (Standard = stdin)
-m n/p/b
Molekültyp:
n Nukleotid (Standard)
p Protein
b Beides
-n Nur neue Datensätze zurückgeben (bei denen sich die angegebene GI auf eine alte Version bezieht)
-o Dateinamen
Name der Ausgabedatei für das XML-INSDSet (Standard = stdout)
-v SNP-Variationen abrufen
Verwenden Sie insdseqget online über die Dienste von onworks.net
