Dies ist der Befehl kmc_tools-union, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
kmc_tools-union – berechnet die Vereinigung zweier KMC-Datenbanken
ZUSAMMENFASSUNG
kmc_tools Gewerkschaft
BESCHREIBUNG
Die Ausgabedatenbank enthält alle in beiden Eingabesätzen vorhandenen k-mers. Für das Selbe
k-mers im ersten und zweiten Eingang, der Zähler im Ausgang ist gleich der Summe
von beiden Eingängen.
OPTIONAL
Für jede Eingabe gibt es zusätzliche Parameter:
-ci
k-mers ausschließen, die weniger als auftreten mal
-cx
Schließen Sie k-mere aus, die häufiger vorkommen mal
Für die Ausgabe gibt es zusätzliche Parameter:
-ci
k-mers ausschließen, die weniger als auftreten mal
-cx
Schließen Sie k-mere aus, die häufiger vorkommen mal
-cs
Maximalwert eines Zählers
BEISPIEL
kmc -k28 Datei1.fastq kmers1 tmp kmc -k28 Datei2.fastq kmers2 tmp kmc_tools Union kmers1
-ci3 -cx70000 kmers2 kmers1_kmers2_union -cs65536
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