Dies ist der Befehl mapMers, der im kostenlosen OnWorks-Hosting-Provider über eine unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
mapMers - Statistiken über die Zuordnung von kmern zu Sequenzen melden
ZUSAMMENFASSUNG
KarteMers {-Statistiken|-Regionen|-Einzelheiten} -m mersize -mers Gehen -seq Fasta
OPTIONAL
-Statistiken meldet den Mittelwert, das Minimum und das Maximum für jede Sequenz zusammen mit einem log2
Histogramm der Zählungen
-Regionen
meldet Regionen mit kmer-Abdeckung
-Einzelheiten
meldet die Vorwärts- und Rückwärtszählung in der Datenbank für jeden kmer in der Sequenz
-m mersize
-mers Gehen
Meryl(1) Datenbank
-seq Fasta
Eingabesequenzdatei
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