Dies ist der Befehl maskAlignedReads, der im kostenlosen OnWorks-Hosting-Provider mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
maskAlignedReads.py - Maskierte Lesevorgänge in der Regionsdatei
BESCHREIBUNG
Verwendung: maskAlignedReads.py [-h] [-v] [-l LOGFILE] [-d] [-i]
inCmpFile inRgnFofn outRgnFofn
Verwenden Sie in.cmp.h5, um entsprechende Bereiche von Dateien in in.rgn.h5 zu maskieren, schreiben Sie die Ausgabe in ein neues
rgn.fofn.
positionell Argumente:
inCmpFile
Eine Eingabedatei cmp.h5.
inRgnFofn
Ein Fofn von Eingaberegion-Tabellendateien.
outRgnFofn
Ein Fofn von Ausgaberegion-Tabellendateien.
optional Argumente:
-h, --help
Diese Hilfemeldung anzeigen und beenden
-v, --Version
Versionsnummer des Programms anzeigen und beenden
-l LOGDATEI, --Logdatei LOGDATEI
Geben Sie eine Datei an, in der Sie sich anmelden möchten. Standardmäßig ist stderr. (Standard: Keine)
-d, --debuggen
Erhöht die Ausführlichkeit der Protokollierung (Standard: False)
-i, --die Info
Anzeige informativer Log-Einträge (Standard: False)
Verwenden Sie maskAlignedReads online mit den onworks.net-Diensten
