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maskAlignedReads - Online in der Cloud

Führen Sie maskAlignedReads im kostenlosen OnWorks-Hosting-Provider über Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator aus

Dies ist der Befehl maskAlignedReads, der im kostenlosen OnWorks-Hosting-Provider mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann

PROGRAMM:

NAME


maskAlignedReads.py - Maskierte Lesevorgänge in der Regionsdatei

BESCHREIBUNG


Verwendung: maskAlignedReads.py [-h] [-v] [-l LOGFILE] [-d] [-i]

inCmpFile inRgnFofn outRgnFofn

Verwenden Sie in.cmp.h5, um entsprechende Bereiche von Dateien in in.rgn.h5 zu maskieren, schreiben Sie die Ausgabe in ein neues
rgn.fofn.

positionell Argumente:
inCmpFile
Eine Eingabedatei cmp.h5.

inRgnFofn
Ein Fofn von Eingaberegion-Tabellendateien.

outRgnFofn
Ein Fofn von Ausgaberegion-Tabellendateien.

fakultativ Argumente:
-h, --help
Diese Hilfemeldung anzeigen und beenden

-v, --Version
Versionsnummer des Programms anzeigen und beenden

-l LOGDATEI, --Logdatei LOGDATEI
Geben Sie eine Datei an, in der Sie sich anmelden möchten. Standardmäßig ist stderr. (Standard: Keine)

-d, --debuggen
Erhöht die Ausführlichkeit der Protokollierung (Standard: False)

-i, --die Info
Anzeige informativer Log-Einträge (Standard: False)

Verwenden Sie maskAlignedReads online mit den onworks.net-Diensten


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