Dies ist der Befehl megamergere, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
Megamerger – Zusammenführung zweier großer, überlappender DNA-Sequenzen
ZUSAMMENFASSUNG
Megafusion -eine Sequenz Reihenfolge -bfolge Reihenfolge -Wortgröße ganze Zahl [-vorziehen boolean]
-seq Fortsetzung -outfile Outfile
Megafusion -Hilfe
BESCHREIBUNG
Megafusion ist ein Kommandozeilenprogramm von EMBOSS („the European Molecular Biology Open
Software-Suite“). Es ist Teil der Befehlsgruppe(n) "Ausrichtung:Konsens".
OPTIONAL
Eingang Abschnitt
-eine Sequenz Reihenfolge
-bfolge Reihenfolge
Erforderlich Abschnitt
-Wortgröße ganze Zahl
Standardwert: 20
Zusätzliche Abschnitt
-vorziehen boolean
Wenn eine Nichtübereinstimmung zwischen den beiden Sequenzen festgestellt wird, wird die eine oder andere der beiden Sequenzen erkannt
Sequenzen müssen verwendet werden, um die zusammengeführte Sequenz über dieser Nichtübereinstimmungsregion zu erstellen. Der
Die Standardaktion besteht darin, die zusammengeführte Sequenz unter Verwendung der Sequenz zu erstellen, in der die Nichtübereinstimmung vorliegt
ist dem Zentrum dieser Sequenz am nächsten. Wenn diese Option verwendet wird, dann die erste Sequenz
(seqa) wird immer vor der anderen Sequenz verwendet, wenn eine vorhanden ist
Nichtübereinstimmung. Standardwert: N
Ausgang Abschnitt
-seq Fortsetzung
-outfile Outfile
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