miview – Online in der Cloud

PROGRAMM:

NAME/FUNKTION

miview – Viewer für medizinische Bilddateien

ZUSAMMENFASSUNG

miview [ Optionen ]

BESCHREIBUNG

miview: Viewer für medizinische Bilddateien

Dateiformate werden automatisch anhand ihrer Dateierweiterung identifiziert.

Global Optionen:
-Explosion: Anzeigegröße um diesen Faktor vergrößern (Standard=1)

-hell: Relative Helligkeit der Anzeige (Standard=0.0)

-Farbe: Farbkarte zur Anzeige von Werten verwenden

-Kontrast: Relativer Kontrast der Anzeige (Standard=0.0)

-Dump: Alle Bilder als Bitmap-Dateien (bmp) ausgeben und beenden, dabei das angegebene Dateinamenpräfix verwenden

-Legende: Legende als Bitmap in diese Datei exportieren

-niedrig: Untere Fenstergrenze: Dieser Wert wird in der Anzeige schwarz angezeigt

-Karte: Overlay-Karte (farbige Voxel, die dem Bild überlagert sind) aus dieser Datei laden

-Kartenlegende: Kartenlegende als Bitmap in diese Datei exportieren

-maplow: Untere Fenstergrenze für Overlay-Karte (Standard = 0.0)

-maprect: Relative Größe der Rechtecke, die Voxel der Overlay-Karte darstellen
(Standard=0.60)

-mapupp: Obere Fenstergrenze für Overlay-Karte (Standard = 0.0)

-noscale: Skalierung in der 2D-/3D-Anzeige deaktivieren

-rec: Angeklickte Koordinaten und Werte in dieser Datei aufzeichnen

-upp: Obere Fenstergrenze: Dieser Wert wird in der Anzeige weiß angezeigt

-Wert: Wert der ROI/Punktauswahl in dieser Datei speichern

-v oder zum Debuggen/Tracing aller Komponenten oder einer einzelnen
Komponente bzw. Mögliche Werte für Loglevel sind: 0(noLog), 1(errorLog),
2 (Warnprotokoll), 3 (Infoprotokoll).

fMRI Optionen (Geben at am wenigsten -Design und -fmri zu aktivieren Sie):
-bonferr: Bonferroni-Korrektur verwenden

-korr: Fehlerwahrscheinlichkeitsschwelle für Korrelation (Standard = 0.050)

-davg: Glätten Sie die Designfunktion mithilfe eines gleitenden Durchschnittsfilters der Breite N (TR).
(Standard=0)

-Design: fMRI-Design aus dieser Datei laden (durch Komma oder Leerzeichen getrennt)

-fmask: fMRI-Maskendatei

-fmri: fMRT-Daten aus dieser Datei laden

-hrf: Faltungsdesignfunktion durch hämodynamische Antwortfunktion vor der Korrelation (siehe
Glover NeuroImage 9, 416-429)

-Nachbar: Minimale nächste Nachbarn mit signifikanter Aktivierung (Standard=1)

-Kurs: Relativen zeitlichen Verlauf der fMRI-Signaländerung in diese Datei kopieren

-klein: Karte der relativen fMRI-Signaländerung in dieser Datei speichern

-zmap: Z-Score-Karte in diese Datei kopieren

-zscore: Z-Score-Schwellenwert für Korrelation (Standard = 0.0)

Reichen Sie das besuch Optionen:
-Datum: Datum des Scans [jjjjmmtt] (Standard = 20140807jjjjmmtt)

-FP: Sichtfeld in Phasenrichtung [mm] (Standard = 220.0 mm)

-Fr: FOV in Leserichtung [mm] (Standard=220.0 mm)

-fs: FOV in Schichtrichtung [mm] (Standard = 5.0 mm)

-Nr: Anzahl aufeinanderfolgender Messungen (Standard=1)

-nx: Anzahl der Punkte in Leserichtung (Standard=1)

-ny: Anzahl der Punkte in Phasenrichtung (Standard=1)

-nz: Anzahl der Punkte in Slice-Richtung (Standard=1)

-Geburt: Geburtsdatum des Patienten [JJJJMMTT] (Standard = 00000000JJJJMMTT)

-pid: Eindeutige Patientenkennung (Standard = Unbekannt)

-pname: Vollständiger Patientenname (Standard = Unbekannt)

-psex: Geschlecht des Patienten (Optionen=MFO, Standard=O)

-pgewicht: Gewicht des Patienten [kg] (Standard = 50.0 kg)

-wissenschaftlich: Name des Wissenschaftlers (Standard = Unbekannt)

-SD: Abstand zwischen den Schichten (von Mitte zu Mitte) [mm] (Standard = 10.0 mm)

-serd: Serienbeschreibung (Standard = Unbekannt)

-serno: Seriennummer (Standard=1)

-st: Scheibendicke [mm] (Standard = 5.0 mm)

-Zucht: Studienbeschreibung (Standard = Unbekannt)

-tcname: Name der Sendespule (Standard = Unbekannt)

-Tee: Zeit bis zum Echo der Sequenz [ms] (Standard = 80.0 ms)

-Zeit: Zeitpunkt des Scans [hhmmss] (Standard=090951hhmmss)

-tr: Zeit zwischen aufeinanderfolgenden Anregungen [ms] (Standard = 1000.0 ms)

-cplx: Behandeln Sie Daten als komplex und extrahieren Sie die angegebene Komponente (Optionen=keine abs pha real
imag , Standard=keine)

-ds: Datensatzindex, der extrahiert werden soll, wenn mehrere Datensätze gelesen werden

-Filter: Nur die Datensätze lesen, deren Protokollparameter „Schlüssel“ die Zeichenfolge enthält
'Wert' (angegeben im Format 'Schlüssel=Wert')

-fmap: Um die Speichernutzung zu reduzieren, behalten Sie die Dateizuordnung bei, nachdem Sie (Roh-)Daten gelesen, aber geschrieben haben
in das Array führt zu einem Absturz

-jdx: Wenn mehrere JDX-Arrays vorhanden sind, wählen Sie diese Option aus

-rDialekt: Daten im angegebenen Dialekt des Formats lesen. (Standard ist kein Dialekt)

-R F: Format lesen, zum Überschreiben der Dateierweiterung verwenden (Optionen=automatische Erkennung, 3db-Analyse, asc
coi dat dcm double float gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit, Standard = automatische Erkennung)

-überspringen: Überspringen Sie diese Anzahl an Bytes, bevor Sie die Rohdaten lesen (Standard = 0).

Filters:
-ausrichten : Daten an der Geometrie (Voxelpositionen) von ausrichten
eine externe Datei

-Automask : Maske mit automatischem histogrammbasierten Schwellenwert erstellen

-Cluster : Erstellen Sie Cluster von benachbarten/nächstnachbarnungleichen Voxeln ungleich Null, sortiert nach Größe

-falten <Faltungskern (Gauss NoFilter Triangle Hann Hamming CosSq Blackman
BlackmanNuttall Exp ),Kerndurchmesser [mm]> : Faltung in räumlichen Dimensionen

-Trend abwenden <Anzahl der zu entfernenden Niederfrequenzkomponenten, Nullmittelwert des Ergebnisses
Zeitverlauf>: Langsame Drift im Laufe der Zeit entfernen

-bearbeiten <Positions-/Bereichszeichenfolge im Format (timeframe,slicepos,phasepos,readpos),neuer Wert
of voxel> : Einzelne Voxelwerte bearbeiten

-genmask : Maske erstellen, die alle Voxel mit Wert enthält
im angegebenen Bereich

-isotrop : Bildvoxel durch Interpolation isotrop machen (image
Geometrie wird sich nicht ändern)

-Tiefpass : Tiefpassfilterung

-max : Alle Werte über dem Maximalwert abschneiden

-maxip : Führen Sie eine Projektion mit maximaler Intensität durch
über vorgegebene Richtung

-verschmelzen : Datensätze durch Erweitern der Zeitdimension zu einem einzigen Datensatz zusammenführen

-Mindest : Alle Werte unter dem Mindestwert abschneiden

-minip : Führen Sie eine Projektion mit minimaler Intensität durch
über vorgegebene Richtung

-noNaN : Ersetzt jedes NaN durch den angegebenen Wert

-pflip : Daten in Phasenrichtung spiegeln

-prange : Bereich auswählen in
Phasenrichtung

-proj : Mittelwertprojektion über gegeben durchführen
Richtung

-quantilmask : Maske erstellen, die alle Voxel über dem angegebenen Bruchteil enthält
Schwelle

-Resample : Zeitliche Größenänderung von Bilddaten

-Größengröße : Räumliche Größenänderung von Bilddaten

-Reslice : schneidet das Bild neu in eine bestimmte Größe
Orientierung

-rflip : Daten in Leserichtung umdrehen

-verrotten : Rotation in der Ebene

-ordnen : Bereich auswählen in
Leserichtung

-Rahmen : Bildwerte neu skalieren

-sflip : Daten in Slice-Richtung spiegeln

-Verschiebung <readRichtungsverschiebung [Pixel],phaseRichtungsverschiebung [Pixel],sliceRichtungsverschiebung
[Pixel]>: Daten räumlich verschieben

-Slicetime : Richtig für
unterschiedliche Erfassungszeitpunkte von Schichten

-spleißen : spleißt die
Bild in die angegebene Richtung

-srange : Bereich auswählen in
Schnittrichtung

-swapdim <[rps][-],[rps][-],[rps][-]>: Dimensionen durch Angabe einer Richtung austauschen/spiegeln
Dreifach mit optionalem Reflexionszeichen angehängt

-Fliese : Schnitte zu einem quadratischen 2D-Bild kombinieren

-seltsam : Bereich auswählen in
Zeitrichtung

-tshift : Daten zeitlich verschieben

-Typmax : Alle Werte über dem Maximum eines bestimmten Datentyps abschneiden

-typemin : Alle Werte unterhalb des Mindestwerts eines bestimmten Datentyps abschneiden

-usemask : Erstellen Sie einen 1D-Datensatz einschließlich aller Werte in der Maske aus der Datei

Unterstützte Datei Erweiterungen (Formate):
3db (Iris3D-Binärdaten)

analysieren
(NIFTI/ANALYZE, Dialekte: fsl)

asc (ASCII, Dialekte: tcourse)

coi (JCAMP-DX-Datensätze)

dat (Matlab ASCII 2D-Datenmatrix)

dcm (DICOM, Dialekte: Siemens)

double (doppelte Rohdaten)

float (Float-Rohdaten)

gz (GNU-Zip-Container für andere Formate)

hdr (Interfile, Dialekte: neurostat)

hdr (NIFTI/ANALYZE, Dialekte: fsl)

idx (3D-Indizes von Nicht-Nullen in ASCII)

ima (DICOM, Dialekte: Siemens)

interfile
(Interfile, Dialekte: Neurostat)

jdx (JCAMP-DX-Bildformat)

mag (DICOM, Dialekte: Siemens)

mhd (MetaImage)

nii (NIFTI/ANALYZE, Dialekte: fsl)

ph (DICOM, Dialekte: Siemens)

png (Portable Network Graphics)

pos (xy-Positionen von Nicht-Nullen in ASCII)

pro (ODIN-Messprotokolle)

reg (Ansoft HFSS ASCII)

s16bit (vorzeichenbehaftete 16-Bit-Rohdaten)

s32bit (vorzeichenbehaftete 32-Bit-Rohdaten)

s8bit (vorzeichenbehaftete 8-Bit-Rohdaten)

smp (JCAMP-DX-Datensätze)

u16bit (vorzeichenlose 16-Bit-Rohdaten)

u32bit (vorzeichenlose 32-Bit-Rohdaten)

u8bit (vorzeichenlose 8-Bit-Rohdaten)

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