Dies ist der Befehl, der im kostenlosen OnWorks-Hosting-Provider mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
propmapped - berechnet den Anteil der zugeordneten Lesevorgänge/Fragmente
ANWENDUNG
angekündigt [Optionen] -i
Erforderliche Argumente:
-i
Eine Eingabedatei mit Lesezuordnungsergebnissen. Sowohl SAM- als auch BAM-Formate sind
unterstützt.
Optionale Argumente:
-o
Name der Ausgabedatei einschließlich Mapping-Statistiken.
-f Falls angegeben, werden Fragmente (Read-Paare) anstelle einzelner Reads gezählt.
Diese Option gilt nur für Paired-End-Lesevorgänge.
-p Falls angegeben, werden nur richtig gepaarte Lesevorgänge gezählt. Diese Option ist nur
gilt für Paired-End-Lesevorgänge.
Verwenden Sie Propmapped online mit den onworks.net-Diensten
