Dies ist der Befehl psize, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
psize – Abmessungen und andere Informationen aus PQR-Dateien abrufen
ZUSAMMENFASSUNG
pGröße [--cfact=Wert] [--fadd=Wert] [--Leerzeichen=Wert] [--gememfac=Wert]
[--gememceil=Wert] [--ofrac=Wert] [--redfac=Wert] {pqrfile}
pGröße {--help | -h}
BESCHREIBUNG
pGröße leitet Informationen aus PQR-Dateien ab, um die Modelle von Proteinen und Chemikalien vorzubereiten
für elektrostatische Berechnungen. Das Tool berechnet Abmessungen für grobe und feine Gitter.
Gitterabstände, Kastengröße und Schätzungen des für die Durchführung einer Elektrostatik erforderlichen Speichers
Berechnung.
Die Berechnung dieser Informationen kann durch die Angabe von Einschränkungen beeinflusst werden pGröße as
Parameter.
OPTIONAL
pGröße akzeptiert die folgenden Optionen:
--help, -h
Drucken Sie eine Hilfenachricht und beenden Sie das Programm.
--cfact=Wert
Faktor, um den die Molekülabmessungen erweitert werden, um die groben Gitterabmessungen zu erhalten
--fadd=Wert
Betrag, der zu den Molekülabmessungen hinzugefügt werden muss, um die feinen Gitterabmessungen zu erhalten.
--Leerzeichen=Wert
Gewünschte feine Netzauflösung.
--gememfac=Wert
Anzahl der Bytes pro Gitterpunkt, die für die sequentielle MG-Berechnung erforderlich sind.
--gememceil=Wert
Maximal zulässige MB für die sequentielle MG-Berechnung. Passen Sie dies an, um das Skript zu erzwingen
Führen Sie schnellere Berechnungen durch (die mehr Parallelität erfordern).
--ofrac=Wert
Überlappungsfaktor zwischen Mesh-Partitionen.
--redfac=Wert
Maximaler Faktor, um den eine Domänendimension beim Fokussieren reduziert werden kann.
Nutzen Sie psize online über die Dienste von onworks.net
