Dies ist der Befehl qlob.pl, der im kostenlosen OnWorks-Hosting-Provider über eine unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
qlob.pl -- Schneller Mursaki-Vergleich ausführen
ZUSAMMENFASSUNG
qlob.pl [Optionen] {Genomliste...}
qlob ist ein Frontend für Murasaki (über qsub, falls verfügbar). Es automatisch
generiert für Sie einen Ausgabenamen basierend auf den Eingabedateien, legt einen vernünftigeren Speicher fest
limit, führt den Job aus und generiert Punktdiagrammausgaben.
Zusätzlich zu den standardmäßigen Murasaki-Optionen (siehe murasaki --help) unterstützt qlob einige
einige eigene Optionen:
Option:
-P verwendet ein altes Muster von 11111100100001111100000100101111
--target= fordert an, dass der Job auf Hostname ausgeführt wird
-n|--name Name für den Job (ermöglicht das Überschreiben der alten Ausgabe)
-m|--mem gibt eine Speicheranforderung für die Übergabe an qsub an (Standard 4 GB)
--mpi=N verwendet MPI auf N Maschinen (setzt auch ppn=4)
--myrinet benötigt Myrinet-Knoten
--kogfile= Führen Sie filter.pl aus, um die Ausrichtung mit zu bewerten
BESCHREIBUNG
Dieser Programm läuft mehrere Sequenzen durch Murasaki. Wenn es auf einem HPC-Rechner ausgeführt wird,
übergibt den Job über qsub.
Verwenden Sie qlob.pl online mit den onworks.net-Diensten
