Dies ist die Linux-App namens ADOMA, deren neueste Version als adoma-1.0.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens ADOMA mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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ADOMA
BESCHREIBUNG
ADOMA steht für: Alternative Display Of Multiple Alignment. ADOMA kann vier verschiedene Darstellungen eines Mehrfachsequenz-Alignments erstellen: ein ClustalW-Alignment im HTML-Format, ein vereinfachtes ClustalW-Alignment im HTML- und/oder TXT-Format und ein farbiges ClustalW-Alignment im HTML-Format. Beispiele für diese Ausgabedateien finden Sie in den Screenshots. ADOMA verwendet ClustalW, um das Mehrfach-Alignment aus DNA- oder Proteinsequenzen zu erstellen und zeigt diese etwas anders an als die normale Ausgabe von ClustalW. ADOMA ist ein Befehlszeilenprogramm, das problemlos in Pipelines verwendet werden kann.
Weitere Informationen finden Sie in der Datei README.md im Abschnitt „Dateien“.
So zitieren Sie ADOMA:
Zaal, D. und Nota, B. (2016), ADOMA: Ein Befehlszeilentool zum Ändern der Mehrfachausrichtungsausgabe von ClustalW. Mol. Inf., 35: 42–44. doi: 10.1002/minf.201500083
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/minf.201500083/abstract
Benutzeroberfläche
Befehlszeile
Programmiersprache
Unix-Shell, Python
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/adoma/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
