Dies ist die Linux-App namens AMBIENT zur Ausführung unter Linux online, deren neueste Version als ambient-1.3.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens AMBIENT herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
AMBIENT für die Online-Laufzeit unter Linux
Ad
BESCHREIBUNG
WICHTIG: Seit der Veröffentlichung der AMBIENT-Methode in BMC Sys Bio wurden mehrere Aktualisierungen vorgenommen. Wenn Sie die im Dokument verwendete Version verwenden möchten, ist es v0.6.3. Ich empfehle jedoch die Verwendung der neuesten Version, die auf die gleiche Weise funktioniert, jedoch über zusätzliche Optionen verfügt und Stabilitäts- und Leistungsverbesserungen aufweist. Danke für Ihr Interesse!AMBIENT (Active Modules for Bipartite Networks) ist ein Python-Modul, das simuliertes Annealing verwendet, um Bereiche eines Stoffwechselnetzwerks (Module) zu finden, die konsistente Eigenschaften aufweisen. AMBIENT erfordert keine vordefinierten Pfade und liefert hochspezifische Vorhersagen über betroffene Stoffwechselbereiche.
Beispielsweise können im Netzwerk Scores für Reaktionen verwendet werden, die auf Transkriptionsdaten ihrer annotierten kodierenden Gene basieren, und es können Module koordinierter Expressionsänderungen gefunden werden. Dies stellt eine Alternative zu Pathway-/Gen-Set-Anreicherungsanalysen dar, die gleichzeitig flexibler und spezifischer ist.
Publikum
Wissenschaftsforschung
Programmiersprache
Python
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/ambient-bio/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
