Dies ist die Linux-App mit dem Namen ArtificialFastqGenerator, deren neueste Version als ArtificialFastqGenerator_19_05_2015.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens ArtificialFastqGenerator mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
ArtificialFastqGenerator
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BESCHREIBUNG
ArtificialFastqGenerator verwendet das Referenzgenom (im FASTA-Format) als Eingabe und gibt künstliche FASTQ-Dateien im Sanger-Format aus. Es kann Phred-Basisqualitätswerte aus vorhandenen FASTQ-Dateien akzeptieren und diese zur Simulation von Sequenzierungsfehlern verwenden. Da die künstlichen FASTQs vom Referenzgenom abgeleitet sind, stellt das Referenzgenom einen Goldstandard für das Aufrufen von Varianten (Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) sowie Insertionen und Deletionen (Indels)) dar. Dies ermöglicht die Evaluierung einer NGS-Analysepipeline (Next Generation Sequencing), die Lesevorgänge am Referenzgenom ausrichtet und dann die Varianten aufruft.Publikum
Gesundheitsindustrie, Wissenschaft/Forschung, fortgeschrittene Endbenutzer
Programmiersprache
Javac
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/artfastqgen/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
