Dies ist die Linux-App namens BarraCUDA Fast Short Read Aligner, deren neueste Version als barracuda_0.7.107h.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens BarraCUDA Fast Short Read Aligner mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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BarraCUDA Fast Short Read Aligner
BESCHREIBUNG
Barracuda ist ein Hochgeschwindigkeits-Sequenz-Aligner, der auf Sangers BWA basiert und die neueste Nvidia CUDA-Architektur verwendet, um das Alignment von Sequenzlesevorgängen zu beschleunigen, die von Sequenzern der nächsten Generation generiert werden.
Eigenschaften
- Probleme beim Kompilieren der Software in Ubuntu 16.04 behoben
- Anpassung: SAMPE 8-Core-Limit ist jetzt aufgehoben
- FM-Index-Sequenzierungs-Read-Mapper-Software mit NVIDIA CUDA-Beschleunigung
- Ausgaben im SAM-Format für nachgelagerte Analysen
- Erfordert NVIDIA-Grafikkarte mit Rechenkapazität 3.5 oder höher und mindestens 1 GB VRAM
- Erfordert NVIDIA CUDA SDK-Toolkit 6.x oder höher und NVIDIA-Treiber 340 oder höher
- BarraCUDA ist veröffentlicht in BMC Research Notes 2012, 5:27, doi:10.1186/1756-0500-5-27
- Papier-URL: http://www.biomedcentral.com/1756-0500/5/27
- Dieses Projekt wird vom CUDA-Kompetenzzentrum der Cambridge University unterstützt
Publikum
Wissenschaftsforschung
Benutzeroberfläche
Befehlszeile
Programmiersprache
C ++, c
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/seqbarracuda/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
