Dies ist die Linux-App namens BiomeNet, die unter Linux online ausgeführt werden kann und deren neueste Version als BiomeNet.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens BiomeNet herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
BiomeNet läuft online unter Linux
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BESCHREIBUNG
Die Metagenomik liefert eine enorme Anzahl mikrobieller Sequenzen, denen eine Stoffwechselfunktion zugeordnet werden kann. Die Verwendung solcher Daten zur Ableitung metabolischer Divergenzen auf Gemeindeebene wird durch das Fehlen eines geeigneten statistischen Rahmens behindert. Hier beschreiben wir ein neuartiges hierarchisches Bayes'sches Modell namens BiomeNet (Bayes'sche Inferenz metabolischer Netzwerke), mit dem auf die unterschiedliche Prävalenz metabolischer Netzwerke zwischen mikrobiellen Gemeinschaften geschlossen werden kann. Um die Struktur von Stoffwechselinteraktionen auf Gemeinschaftsebene abzuleiten, wendet BiomeNet ein Modellierungsrahmenwerk mit gemischten Mitgliedern auf Informationen zur Enzymhäufigkeit an. Die Grundidee besteht darin, dass die Mischungskomponenten des Modells (Stoffwechselreaktionen, Teilnetzwerke und Netzwerke) von allen Gruppen (Mikrobiomproben) gemeinsam genutzt werden, die Mischungsverhältnisse jedoch von Gruppe zu Gruppe variieren. Durch dieses Framework kann das Modell verschachtelte Strukturen innerhalb der Daten erfassen. BiomeNet ist einzigartig darin, jede Metagenomprobe als eine Mischung komplexer Stoffwechselsysteme (Metabosysteme) zu modellieren.Publikum
Wissenschaftsforschung
Programmiersprache
C++, S/R
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/biomenet/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
