Dies ist die Linux-App namens CaptureProbe, deren neueste Version als Runningexample.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens CaptureProbe mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
CaptureProbe
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BESCHREIBUNG
Hier haben wir CaptureProbe entwickelt, ein benutzerfreundliches und grafisches Java-Tool zum Entwerfen von Capture-Probes für Capture Hi-C-Anwendungen. CaptureProbe ist einfach zu verwenden, benötigt nur einfache Eingabedateien und bietet zahlreiche Parameter zum Entwerfen von Sonden. CaptureProbe kann Sonden speziell für Genomstandorte und Genomregionen von Interesse entwerfen. Vergleiche mit vorhandener Software (HiCapTools und GOPHER) zeigten, dass CaptureProbe eine gute Design-Erfolgsquote und eine bessere Sondenspezifität aufweist.
Zitat: MA YF, ADEOLA AC, SUN YB, et al. 2020. CaptureProbe: ein Java-Tool zum Entwerfen von Sonden für Capture-Hi-C-Anwendungen. Zool Res [J], 41: 94-96.
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/captureprobe/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
