Dies ist die Linux-App mit dem Namen CSBB-v3.0, die unter Linux online ausgeführt werden soll und deren neueste Version als CSBB-v3.0.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens CSBB-v3.0 herunter und führen Sie sie online aus, um sie online mit OnWorks kostenlos unter Linux auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
CSBB-v3.0 läuft unter Linux online
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BESCHREIBUNG
CSBB ist eine kommandozeilenbasierte Bioinformatik-Suite zur Analyse biologischer Daten, die durch verschiedene Wege biologischer Experimente gewonnen wurden. CSBB ist in Perl implementiert, nutzt aber auch die Verwendung von R, Java, Python und Ruby im Hintergrund für bestimmte Module. Das Hauptaugenmerk des CSBB liegt darauf, Benutzern aus der Biologie- und Bioinformatik-Community die Möglichkeit zu geben, von der Durchführung von Downstream-Analyseaufgaben zu profitieren, während das Schreiben von Programmiercode entfällt. CSBB ist derzeit unter Linux, UNIX verfügbar.Derzeit bietet CSBB 18 Module, die sich auf analytische Aufgaben wie die Durchführung der Normalisierung der oberen Quantile, interaktive Visualisierung und Sequenzierungspipelines der nächsten Generation konzentrieren. CSBB kann nun auch öffentliche Daten verarbeiten. Bereitstellung einer End-to-End-Pipeline-Erfahrung für den Benutzer.
Eigenschaften
- RNA-Seq
- ChIP-Seq
- ATAC-Seq
- Normalisierung
- Differentialausdruck
- Öffentliche Datenverarbeitung
- End-to-End-Pipelines
- Open Source
- Visualisierung
- Bioinformatik
Publikum
Wissenschaftsforschung
Programmiersprache
Perl
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/csbb-v3-0/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
