Dies ist die Linux-App mit dem Namen GenOO-HTS zur Ausführung unter Linux online, deren neueste Version als genoo-code-2013_04_18.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens GenOO-HTS herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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GenOO-HTS läuft online unter Linux
BESCHREIBUNG
GenOO-HTS [jee-noo] ist ein Open-Source-Programm; objektorientiertes Perl-Framework, das speziell für das Design von High Throughput Sequencing (HTS)-Analysetools entwickelt wurde. Das primäre Ziel von GenOO-HTS ist es, einfache HTS-Analysen einfache und komplizierte Analysen zu ermöglichen. GenOO-HTS modelliert biologische Entitäten in Perl-Objekte und stellt relevante Attribute und Methoden bereit, die die Manipulation von Sequenzierungsdaten mit hohem Durchsatz ermöglichen. Die Verwendung von GenOO-HTS als zentrales Entwicklungsmodul reduziert den Aufwand und die Komplexität der Verwaltung der Daten und der vorhandenen biologischen Einheiten. GenOO-HTS ist flexibel und leicht erweiterbar mit modularem Aufbau und minimalen Anforderungen an externe Tools und Bibliotheken.Eigenschaften
- Organisieren Sie biologische Einheiten als Perl-Objekte (genomische Regionen, Gene, Transkripte, Introns/Exons usw.)
- Organisieren Sie Sequenzierungsentitäten als Perl-Objekte/Attribute (Sequenzierungslesevorgänge, Ausrichtungen usw.)
- Erleichtern Sie I/O von weit verbreiteten Dateiformaten (SAM, BED, FASTA, FASTQ)
- Seien Sie konsistent und leicht erweiterbar
Publikum
Wissenschaft/Forschung, Entwickler
Programmiersprache
Perl
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/genoo/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
