Dies ist die Linux-App namens HomSI, die unter Linux online ausgeführt werden kann und deren neueste Version als HomSI.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens HomSI herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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HomSI läuft unter Linux online
BESCHREIBUNG
In blutsverwandten Familien haben die Individuen aufgrund der Vererbung der gleichen Genomsegmente durch beide Elternteile Abschnitte ihres Genoms, die homozygot sind. Diese Situation führt zur Prävalenz rezessiver Erkrankungen unter den Mitgliedern dieser Familien. Die Kartierung der Homozygotie basiert auf dieser Beobachtung und mithilfe dieser Technik wurden mehrere rezessive Krankheitsgene in blutsverwandten Familien entdeckt. Die Forscher verwenden typischerweise SNP-Arrays, um die homozygoten Regionen zu bestimmen und dann nach dem Krankheitsgen zu suchen, indem sie die Gene innerhalb dieser Kandidaten-Krankheitsorte sequenzieren. Mit dem Aufkommen der Next-Generation-Sequenzierung ist es seit kurzem möglich, homozygote Regionen gleichzeitig zu identifizieren und für die Diagnose relevante Mutationen anhand von Daten aus einem einzigen Sequenzierungsexperiment zu erkennen. In diesem Zusammenhang haben wir ein neuartiges Tool entwickelt, das homozygote Regionen mithilfe von Deep-Sequence-Daten identifiziert. Mithilfe von *.vcf-Dateien als Eingabedatei identifiziert unser Programm den MajoEigenschaften
- Homozygotiekartierung auf NGS-Daten
Benutzeroberfläche
Java-SWT
Programmiersprache
Javac
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/homsi/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
