Dies ist die Linux-App namens iPiG, die unter Linux online ausgeführt werden kann und deren neueste Version als ipig_r5.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens iPiG herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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iPiG läuft unter Linux online
BESCHREIBUNG
iPiG zielt auf die Integration von Peptidspektrum-Matches (PSMs) aus der Massenspektrometrie (MS) ab.Peptididentifizierungen in Genomvisualisierungen, die von einem Genombrowser wie dem UCSC-Genombrowser bereitgestellt werden (http://genome.ucsc.edu/).
iPiG übernimmt PSMs aus dem MS-Standardformat mzIdentML (*.mzid) oder im Textformat und liefert Ergebnisse in Genom-Track-Formaten (BED- und GFF3-Dateien), die einfach in Genombrowser importiert werden können.
Weitere Einzelheiten zu iPiG und seiner Funktionalität finden Sie unter
„iPiG: Integration von Peptidspektrum-Übereinstimmungen in Genom-Browser-Visualisierungen“
Mathias Kuhring und Bernhard Y. Renard
(http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0050246)
Publikum
Wissenschaftsforschung
Benutzeroberfläche
Java Swing, Konsole/Terminal
Programmiersprache
Javac
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/ipig/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
