Dies ist die Linux-App namens MendelChecker, deren neueste Version als MendelChecker_v2.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens MendelChecker mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
MendelChecker
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BESCHREIBUNG
MendelChecker ist ein wahrscheinlichkeitsbasiertes Maß für die Mendelsche Segregation von Single Nucleotid Polymorphisms (SNPs) in nuklearen Stammbäumen. Wir haben diese Methode als Qualitätskontrollmaßnahme für die Entdeckung neuer Varianten aus verrauschten Sequenzierungsdaten der nächsten Generation in Stammbäumen entwickelt, wie z. B. Restriktionsstellen-assoziierte DNA-Sequenzierung (RAD-seq) in Nichtmodellorganismen. Diese Methode implementiert einen Vergleich von heterogametischer vs. homogametischer Übertragung, dh geschlechtsgebundener vs. autosomaler Segregation.
Eigenschaften
- Messen Sie die Wahrscheinlichkeit einer Mendelschen Übertragung in Stammbäumen
- Zuweisung von Autosom vs. Geschlechtschromosomen
- Liest die Standard-GATK-Ausgabe
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/mendelchecker/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.