Dies ist die Linux-App mit dem Namen MetaPhat -meta-pheno-association-tracker, deren neueste Version als meta_phat.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens MetaPhat -meta-pheno-association-tracker mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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MetaPhat -meta-pheno-association-tracker
BESCHREIBUNG
MetaPhat ist ein aktives Open-Source-Tool (MIT-Lizenz) zur Erkennung von Varianten mit multivariaten Assoziationen mithilfe zusammenfassender Statistiken aus univariaten GWAS-Studien. Die Anwendung führt auch eine Zerlegung durch, indem sie optimale BIC-Teilmengen und P-Wert-Treibermerkmale für die multivariaten Leitvarianten findet. Variantenergebnisse werden verfolgt und geclustert, um die Analyse von Phänotyp-Genotyp-Beziehungen zu erleichtern.Installationsanweisungen, erforderliche GWAS-Datenformate und Beispieleingaben mit Testbefehl finden Sie auf unserer Wiki-Startseite. https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Home/
Globale Lipide (GLGC, Willer 2013) Daten/Quelle Teer-Beispiel – https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
Wenn Sie nach dem Ausprobieren des Beispiels und dem Lesen des Tutorials auf Probleme stoßen oder Funktionswünsche haben, senden Sie bitte eine E-Mail an: [E-Mail geschützt]
Urheberrecht <2019> [E-Mail geschützt] , [E-Mail geschützt]
Eigenschaften
- multivariate genomweite Merkmalsanalyse
- p-Wert- und BIC-basierte Auswahl optimaler Merkmalsteilmengen
- Trait-Zerlegungs-Trace-Plots
- Haupt-SNP- und Fahrermerkmals-Zusammenfassungsdatei
- SNP-SNP-Merkmal Rang Spearman-Cluster
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
