Dies ist die Linux-App namens MIRA, deren neueste Version als mira-4.0.2.tar.bz2 heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens MIRA mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
MIRA
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BESCHREIBUNG
MIRA – Sequenzassembler und Sequenzkartierung für Shotgun- und EST/RNAseq-Sequenzierungsdaten des gesamten Genoms. Kann Sanger-, 454-, Illumina- und IonTorrent-Daten verwenden. PacBio: CCS und fehlerkorrigierte Daten nutzbar, unkorrigiert noch nicht.
Eigenschaften
- Ermöglicht hybride Assemblierungen von Sanger-, 454-, Solexa-, IonTorrent- und PacBio-Daten (CCS und ecCLR).
- Kann gepaarte und/oder ungepaarte Daten verwenden
- Unterstützt Zusatzdaten im TRACEINFO-Format (von NCBI)
- Markiert Sehenswürdigkeiten mit Tags, damit diese in Finishing-Programmen schnell gefunden werden können
- Verfügt über eine SNP-Analysepipeline zur Sequenzierung von Daten von Viren und Prokaryonten
Publikum
Fortgeschrittene Endbenutzer, Wissenschaft/Forschung
Benutzeroberfläche
Befehlszeile
Programmiersprache
C + +
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/mira-assembler/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
