Dies ist die Linux-App namens Molecular Dynamics Studio, deren neueste Version als WindowsRelease.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens Molecular Dynamics Studio mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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Molekulardynamik-Studio
BESCHREIBUNG
Dies ist eine Sammlung von Softwaremodifikationen, die entwickelt wurden, um NanoEngineer-1, PACKMOL und MSI2LMP zu integrieren, um auf einfache Weise molekulardynamische Zellen zu erstellen. NanoEngineer-1 ist eine molekulare CAD-Software, die von Nanorex geschrieben wurde und dem Benutzer eine einfache Möglichkeit bietet, Moleküle zu erstellen, während die Softwaremodifikationen dem Benutzer ermöglichen, Atome mit mehreren Kraftfeldern zu tippen. PACKMOL kann eine zufällige Sammlung von Molekülen unter Verwendung der Molekül-Templates von NanoEngineer-1 erzeugen und so die anfängliche MD-Zelle bereitstellen. Änderungen an PACKMOL ermöglichen die Weitergabe der Atomtypdaten an die MSI2LMP-Software. MSI2LMP erstellt eine LAMMPS-Eingabedatei basierend auf Kraftfeldern der Klasse I oder II. MSI2LMP wurde modifiziert, um numerisch codierte Kraftfelddaten zu verwenden, die von NanoEngineer-1 generiert wurden. Das Dateiformat MMP wurde erweitert und in alle drei Softwareanwendungen integriert.
http://www.nanoengineer-1.net
http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/
http://lammps.sandia.gov/
Eigenschaften
- Molekulare CAD-Fähigkeit über NanoEngineer-1
- Geben Sie Atome basierend auf dem atomistischen Kraftfeld CFF91 manuell ein
- Erstellen Sie Molekülvorlagen mit NanoEngineer-1
- Generieren Sie eine MD-Zelle mit PACKMOL und mehreren Molekülvorlagen
- Generieren Sie eine LAMMPS-Geometrie-Eingabedatei mit MSI2LMP
Publikum
Wissenschaftsforschung
Benutzeroberfläche
OpenGL, Qt
Programmiersprache
Fortran, Python, C++, C
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/moleculardynami/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
