Dies ist die Linux-App namens MoPAC, deren neueste Version als MoPAC_0.3.1.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens MoPAC mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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MoPAC
BESCHREIBUNG
Um den Vergleich der Gen-Essentialitäten in zwei oder mehr Zellproben zu erleichtern, schlagen wir MoPAC (Modular Pipeline for Analysis of CRISPR screens) vor, ein Shiny-gesteuertes interaktives Tool für die differenzielle Essentialitätsanalyse in CRISPR/Cas9-Screens.
Anweisungen zur Installation und Verwendung finden Sie auf der Wiki-Seite.
Eigenschaften
- Unvoreingenommene Messung der differentiellen Gen-Essentialität in CRISPR-Screenings.
- Benutzerfreundlichkeit durch eine interaktive grafische Benutzeroberfläche.
- Bei jedem Schritt der Analyse werden publikationsreife Zahlen generiert.
- Als Eingabe sind sowohl FASTQ-Dateien als auch Read-Count-Tabellen (vor oder nach der Normalisierung) zulässig.
- Genkategoriebasierte Qualitätskontrolle zur Erkennung und Filterung von Ausreißern.
- Integrierte Genontologieanalyse im STRINGdb R-Paket.
- Schnelle Verarbeitung durch C++-Kompilierung rechenintensiver Schritte.
Publikum
Wissenschaftsforschung
Benutzeroberfläche
Webbasierte
Programmiersprache
C++, S/R
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/mopac/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
