Dies ist die Linux-App namens MSTgold, deren neueste Version als MSTgoldpackage.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens MSTgold kostenlos mit OnWorks herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
MSTgold
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BESCHREIBUNG
Algorithmen mit minimalem Spannbaum (MST) können mehrere gleich minimale MSTs erzeugen, aber MST-Programme melden typischerweise nur einen willkürlich gewählten MST. Ebenso bieten die meisten MST-Programme keine statistischen Metriken, um die Glaubwürdigkeit der von ihnen geschätzten MSTs zu untermauern.
MSTgold schätzt die Anzahl alternativer MSTs, meldet eine vom Benutzer festgelegte Anzahl dieser Bäume, meldet einen Konsensbaum und implementiert eine Bootstrapping-Metrik, um die Zuverlässigkeit alternativer MST-Lösungen zu bewerten.
MSTgold akzeptiert Einzelzeichendaten, bei denen es sich um Nukleotide, Aminosäuren, Binärzeichen oder SNPs handelt; ganze Zahlen, die beispielsweise die Längen von VNTRs oder Mikrosatelliten darstellen; und Distanzmatrizen.
Das MSTgold-Paket enthält ausführbare Mac OS X-, Linux- und Windows-Programme des MSTgold-Programms, ein ausführliches Handbuch, Beispieldaten und -ergebnisse sowie ausführbare Dateien des Programms Fasta2MSTG, das Fasta-Sequenzdateien in das MSTgold-Eingabeformat konvertiert.
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/mstgold/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
