Dies ist die Linux-App namens OptimizeSNP, die unter Linux online ausgeführt werden kann und deren neueste Version als Optimize1.0code.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens OptimizeSNP herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
Optimieren Sie SNP für die Online-Ausführung unter Linux
Ad
BESCHREIBUNG
Das Programm wendet lineare Programmierung an, um die Anzahl der Mikroarrays und Hybridisierungsexperimente zu minimieren, die durchgeführt werden müssen, um die meisten vorhergesagten ausgedrückten SNPs abzudecken. Abhängigkeiten:. 1) mampl.exe muss sich im Systempfad befinden. 2) CPLEX 12.2 muss installiert sein. cplexamp.exe muss sich im Systempfad befindenmampl.exe kann von jedem Programm bezogen werden, das AMPL enthält. Ich habe AMPL von der Testversion von MOSEK unter erhalten http://www.mosek.com/. CPLEX 12.0 ist erhältlich unter http://www-01.ibm.com/software/integration/optimization/cplex-optimizer/. Eine kostenlose akademische Lizenz kann durch Ausfüllen des IBM-Antrags für akademische Initiativen erworben werden.
Publikum
Wissenschaftsforschung
Programmiersprache
Perl
Datenbankumgebung
Flachdatei
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/optimizesnp/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
