Dies ist die Linux-App namens pipasic zur Ausführung unter Linux online, deren neueste Version als example.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens pipasic herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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pipasic kann unter Linux online ausgeführt werden
BESCHREIBUNG
Die metaproteomische Analyse ermöglicht die Untersuchung des Zusammenspiels von Organismen oder funktionellen Gruppen und erfreut sich auch für diagnostische Zwecke zunehmender Beliebtheit. Allerdings ergeben sich aufgrund der hohen Sequenzähnlichkeit zwischen verwandten Organismen Schwierigkeiten. Darüber hinaus kann der Konservierungszustand von Proteinen zwischen Arten mit ihrem Expressionsniveau korreliert werden, was zu erheblichen Verzerrungen bei den Ergebnissen und der Interpretation führen kann. Diese Herausforderungen ähneln den Herausforderungen, die sich bei der Analyse metagenomischer Proben ergeben, sind jedoch nicht identisch mit diesen und erfordern spezifische Lösungen.Pipasic (Peptidintensitätsgewichtete Proteomhäufigkeitsähnlichkeitskorrektur) ist ein Tool, das auf der Identifizierung und Spektralzählung basierende Quantifizierungsergebnisse mithilfe der Peptidähnlichkeitsschätzung und der Gewichtung des Expressionsniveaus innerhalb eines nicht-negativen Lasso-Frameworks korrigiert. Pipasic hat deutliche Vorteile gegenüber Ansätzen, die sich nur auf einzelne Peptide oder die Aggregation von Ergebnissen auf den niedrigsten gemeinsamen Vorfahren beziehen.
Publikum
Wissenschaftsforschung
Benutzeroberfläche
Befehlszeile
Programmiersprache
Python
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/pipasic/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
