Dies ist die Linux-App namens PolyCTLDesigner zur Online-Laufung unter Linux, deren neueste Version als dist_PolyCTLDesigner.0.3.a.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens PolyCTLDesigner herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
PolyCTLDesigner zur Online-Ausführung unter Linux
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BESCHREIBUNG
Anhand der Peptide (T-Zell-Epitope) wählt PolyCTLDesigner flankierende Sequenzen aus, um die TAP-Bindung zu optimieren, und verbindet die resultierenden Oligopeptide so zu einem Polyepitop, dass eine effiziente Freisetzung potenzieller Epitope durch proteasomale und/oder immunproteasomale Verarbeitung gewährleistet und die Anzahl der Verbindungsepitope minimiert wird. Für die Konstruktion von Polyepitopen nutzt PolyCTLDesigner bekannte Aminosäuremuster der Proteasom-Spaltung und TAP-Bindungsspezifität. PolyCTLDesigner ist auch in der Lage, antigenische Peptide auszuwählen, die ein ausgewähltes HLA-Repertoire mit der gewünschten Redundanzrate abdecken. Aufgrund der Antigensequenzen ist PolyCTLDesigner auch in der Lage, T-Helfer-Epitope auszuwählen. Zur Vorhersage von T-Zell-Epitopen wird TEpredict verwendet.Publikum
Wissenschaftsforschung
Programmiersprache
Python
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/polyctldesigner/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
