Dies ist die Linux-App namens RGAAT, deren neueste Version als RGAAT.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens RGAAT mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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RGAAT
BESCHREIBUNG
Dieses Programm kann das Genom für ein neues Genom und ein bekanntes Genom-Upgrade mithilfe einer Sequenzausrichtungsdatei (SAM- oder BAM-Format), einer Sequenzvariantendatei (VCF-Format) oder einer fünfspaltigen Tabelle (durch Tabulatoren getrennt, einschließlich Chromosom, Position, ID, Referenz) zusammenstellen und/oder annotieren Allel und alternatives Allel)) oder neue Genomsequenzdatei (FASTA-Format) basierend auf einer Referenzgenomsequenzdatei (FASTA-Format) und einer Annotationsdatei (TBL-, GTF-, GFF-, GFF3- oder BED-Format).
Eigenschaften
- Identifizierung von Sequenzvariationen
- Aufbau einer Genomkonsenssequenz
- Genommodifikation
- Genomvergleich
- Genom-Annotation
- Aufbau einer Genomkoordinatenkonvertierung zwischen verschiedenen Genomassemblierungsversionen
Publikum
Wissenschaftsforschung
Programmiersprache
Perl
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/rgaat/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
