Dies ist die Linux-App namens RNA@, deren neueste Version als RNAAT-V1.1.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens RNA@ mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
Ad
RNA@
BESCHREIBUNG
RNA@ ist ein RNA-Annotationstool für prokaryontische Organismen, das auf einem vereinfachten Aho-Corasick-ähnlichen Algorithmus basiert. Das Prinzip des Algorithmus besteht darin, einen Datensatz von Nukleotidsequenzen in eine Finite State Machine zu codieren, die in der Lage ist, jedes Vorkommen jeder Nukleotidsequenz in einem Genom in einem einzigen Lesevorgang des Genoms zu erkennen. Als Nukleotidsequenzdatensatz verwendet RNA@ eine Sammlung von etwa 300,000 RNA, die beim NCBI hinterlegt ist. Diese RNA wird automatisch aus etwa 25,000 vollständig hinterlegten Genomen gesammelt.
Sie finden unter https://drive.google.com/file/d/1lEj5SSHpQSv54nOroxBcS_jvLFRIKNmm/view?usp=sharing" die von RNA@ neu annotierte RNA für 30,558 Genome von Archaea und Bakterien (alle Archaeen- und Bakteriengenome, die als "Complete Genomes" oder "Chromosom" gekennzeichnet sind, unter den Genomen, die am NCBI-Tag 06. Juni 2021 hinterlegt wurden.
Sie können die letzte Version der Datenbank auch herunterladen unter http://rnaat.ufpa.br
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/rnaat/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
