Dies ist die Linux-App namens SASHIMI, deren neueste Version als TPP_Setup_6.3.3.exe heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens SASHIMI mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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SASHIMIA
BESCHREIBUNG
Das Sashimi-Projekt beherbergt die Trans-Proteomic Pipeline (TPP), eine ausgereifte Suite von Tools für die auf Massenspektren (MS, MS/MS) basierende Proteomik: statistische Validierung, Quantifizierung, Visualisierung und Konverter von MS-Rohdaten in die offenen mzML/mzXML-Formate.
Eigenschaften
- Datenbank-Suchmaschinen (Komet etc.)
- SpecraST (Spektrumbibliothek-Suchmaschine)
- Offene Massensuche (Magnum etc.)
- Kojak (Vernetzte Suche)
- DDA-Analyse
- DISCo (DIA-Analyse)
- reSpect (Chimäre Spektrumanalyse)
- MS1- und MS2-Quantifizierung Beschriftet und unbeschriftet
- Decoy-Datenbankgenerierung
- PeptideProphet (PSM-Level-Validierung)
- iProphet (Validierung des Peptidspiegels)
- PTMProphet (Posttranslationale Modifikationsvalidierung)
- Validierung des Proteingehalts
- Generierung der Spektrumbibliothek
- Datenvisualisierungstools
- Katalogisierung und Vorhersage der Aufbewahrungszeit
Publikum
Wissenschaftsforschung
Benutzeroberfläche
Webbasiert, Befehlszeile
Programmiersprache
Python, Perl, C++, C, JavaScript, Java
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/sashimi/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
