Dies ist die Linux-App namens TagGraph, deren neueste Version als WindowsDockerTG.1.8.1.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens TagGraph mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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TagGraph
BESCHREIBUNG
Obwohl sich die Massenspektrometrie gut zur Identifizierung Tausender potenzieller posttranslationaler Proteinmodifikationen (PTMs) eignet, war sie in der Vergangenheit auf nur wenige beschränkt. Um den gesamten Satz von PTMs über verschiedene Proteome hinweg zu messen, muss die Software die doppelte Herausforderung meistern, riesige Suchräume abzudecken und richtige von falschen Spektruminterpretationen zu unterscheiden. Hier beschreiben wir TagGraph, ein Rechentool, das beide Herausforderungen mit einer uneingeschränkten stringbasierten Suchmethode meistert, die bis zu 350-mal schneller ist als bestehende Ansätze, und einem probabilistischen Validierungsmodell, das wir für PTM-Aufgaben optimiert haben. Wir haben TagGraph auf einen veröffentlichten menschlichen Proteomdatensatz mit 25 Millionen Massenspektren angewendet und die sichere Spektrenidentifizierung im Vergleich zur ursprünglichen Analyse verdreifacht. Wir haben Tausende von Modifikationstypen an fast 1 Million Stellen im Proteom identifiziert.Eigenschaften
- Komplexe Proteome mit String definieren
Publikum
Bildung
Benutzeroberfläche
Befehlszeile
Programmiersprache
Python
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/taggraph/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
