Dies ist die Windows-App namens AutoDockParser, deren neueste Version als AutodockParser.exe heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens AutoDockParser mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
AutoDockParser
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BESCHREIBUNG
AutoDock Suit ist eine der beliebtesten Software zur Durchführung von Molecular Docking und Virtual Screening. Dieser Anzug bietet zwei Programme: AutoDock und AutoDock Vina. AutoDock stellt seine Ausgabe als Docking-Protokolldateien (DLG-Dateien) bereit, während letzteres im pdbqt-Format ausgibt.
Die Nachbearbeitung dieser Ergebnisse blieb lange Zeit eine manuelle Aufgabe und daher werden verschiedene Protokolle und Arbeitsabläufe benutzerspezifisch entwickelt. Die manuelle Verarbeitung dieser Ergebnisse für die anschließende Interaktionsanalyse ist nach wie vor eine zeitaufwändige und scheinbar alltägliche Aufgabe. Bei der manuellen Verarbeitung ist man auf verschiedene externe Software angewiesen.
AutoDock Parser bietet eine automatische Nachbearbeitung der von AutoDock Suit erhaltenen Docking-Ergebnisse. AutoDock Parser ist ein benutzerfreundliches Tool, das darauf abzielt, den Aufwand bei der Nachbearbeitung von Docking-Ergebnissen zu minimieren. Es ermöglicht dem Benutzer, in einem einzigen Schritt Protein-Ligand-Komplexe aus den eingegebenen DLG/PDBQT-Dateien zu erstellen.
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/autodockparser/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
