Dies ist die Windows-App namens Covidex, deren neueste Version als Covidex_2021_11_27.rar heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens Covidex mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
SCREENSHOTS
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Covidex
BESCHREIBUNG
Virale Subtypen oder Kladen repräsentieren Cluster unter Isolaten aus der globalen Population einer definierten Art. Die Subtypisierung ist für Studien zur Virusepidemiologie, -evolution und -pathogenese relevant. In diesem Sinne wurde Covidex als Open-Source-Alignment-freies Machine-Learning-Subtyping-Tool entwickelt. Es ist eine glänzende App, die eine schnelle und genaue Klassifizierung viraler Genome in vordefinierten Clustern ermöglicht. Wenn mehr als 1000 Sequenzen geladen sind, wird das Tool im Multithread-Modus ausgeführt. Kann 16000 Genomsequenzen in weniger als einer Minute klassifizieren (AMD Ryzen 7 1700 8-Core-Prozessor 3 GHz)
Für eine webbasierte Version der App (nur für kleine Datensätze: 100 sek. max.) gehen Sie bitte zu
http://covidex.unlu.edu.ar
Wenn Sie Covidex verwenden, denken Sie bitte daran, den folgenden Vordruck zu zitieren:
https://biorxiv.org/cgi/content/short/2020.08.21.261347v1
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Eigenschaften
- Subtypisierung von Sequenzen
- Benutzerfreundliche Oberfläche
- Übersichtsdiagramme
- Portable Version für Windows (keine Installation erforderlich)
- Multithread-Modus
Publikum
Wissenschaft/Forschung, Endbenutzer/Desktop
Programmiersprache
R
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/covidex/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
