Dies ist die Windows-App namens MAGeCK, deren neueste Version als broadgpp-brunello-library-corrected.txt.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens MAGeCK mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
SCREENSHOTS
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MageCK
BESCHREIBUNG
Die modellbasierte Analyse des genomweiten CRISPR-Cas9-Knockouts (MAGeCK) ist ein Rechenwerkzeug zur Identifizierung wichtiger Gene aus der aktuellen CRISPR-Cas9-Knockout-Screening-Technologie auf Genomskala.
Anweisungen und Dokumentationen finden Sie auf der Wiki-Seite.
MAGeCK wird von Wei Li und Han Xu aus dem Labor von Dr. Xiaole Shirley Liu am Dana-Farber Cancer Institute/Harvard School of Public Health entwickelt und wird vom Wei Li Labor am Children's National Medical Center betreut. Wir danken der Unterstützung von Claudia Adams Barr Program in Innovative Basic Cancer Research und NIH/NHGRI bei der Entwicklung von MAGeCK.
Eigenschaften
- Der beliebteste Rechenalgorithmus in der Screening-Analyse
- Über 400 Zitate und 60 Downloads
- Einfache, benutzerfreundliche Pipeline zum Screening von Genen in genomweiten CRISPR-Cas9-Knockout-Experimenten
- Eine vollständige Dokumentation mit einfach zu startenden Tutorials
- Hohe Sensitivität und niedrige Fehlerkennungsrate
- Aktive Pflege des Quellcodes mit neuen Funktionen und Fehlerbehebungen
- Unterstützung durch die Entwickler- und Benutzer-Community
- Eine Reihe von Visualisierungsfunktionen, die Veröffentlichungsstandardzahlen generieren
Publikum
Wissenschaftsforschung
Programmiersprache
Python, C
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/mageck/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
