Dies ist die Windows-App mit dem Namen MetaPhat -meta-pheno-association-tracker, deren neueste Version als plasma_lipids_decomposed.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens MetaPhat -meta-pheno-association-tracker mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
SCREENSHOTS
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MetaPhat -meta-pheno-association-tracker
BESCHREIBUNG
MetaPhat ist ein Open-Source-Programm zur Erkennung optimaler Teilmengenmerkmale auf Leit-SNP-Assoziationen aus mehreren Biomarker-GWAS-Zusammenfassungsergebnissen. Die besten Merkmale werden aus der systematischen Zerlegung multivariater Assoziationen in zentrale Merkmale basierend auf dem optimalen BIC und P-Wert aus multivariaten CCA-Modellen abgeleitet. SNP-Trace-Ergebnisse werden grafisch dargestellt und geclustert, um die Spezifität von mv-Phänotyp-Genotyp-Assoziationen zu analysieren und zu verbessern.
freigegeben mit LD-Funktion https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
Schnellstart https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Quick%20Start
Eingänge https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Inputs
Beispiel für globale Lipide https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Installation_global_lipids
Zitieren: Lin et al. (2020) MetaPhat: Erkennung und Zerlegung multivariater Assoziationen aus univariaten genomweiten Assoziationsstatistiken. Vorderseite. Genet. doi: 10.
Eigenschaften
- multivariate genomweite Merkmalsanalyse
- p-Wert- und BIC-basierte Auswahl optimaler Merkmalsteilmengen
- Trait-Zerlegungs-Trace-Plots
- Population und LD blockieren die Verklumpung
- Haupt-SNP- und Fahrermerkmals-Zusammenfassungsdatei
- SNP-SNP-Merkmal Rang Spearman-Cluster
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
