Dies ist die Windows-App namens miRNA Temporal Analyzer (mirnaTA), die unter Windows online über Linux online ausgeführt werden kann. Die neueste Version kann als mirnaTA_v1.2.3.tar.gz heruntergeladen werden. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens miRNA Temporal Analyzer (mirnaTA) herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Windows online über Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
SCREENSHOTS
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miRNA Temporal Analyzer (mirnaTA) zur Ausführung unter Windows online über Linux online
BESCHREIBUNG
Der microRNA Temporal Analyzer (mirnaTA) ist ein Bioinformatik-Tool, mit dem differenziell exprimierte miRNAs in temporalen Studien identifiziert werden können. Es ist im Perl- und R-Paket (>= 2.13.0) implementiert und kann auf mehreren Plattformen wie Linux, Mac und Windows ausgeführt werden. Die mirnaTA erfordert, dass Benutzer Daten von mindestens zwei Zeitpunkten bereitstellen und bis zu 20 Zeitpunkte analysieren. Um die Daten zu normalisieren und die technische Variabilität zu beseitigen, wurde die Normal Quantile Transformation (NQT) verwendet, und die normalisierten Daten werden unter Verwendung des linearen Regressionsmodells analysiert, um alle miRNAs zu lokalisieren, die auf lineare Weise differentiell exprimiert werden. Alle miRNAs mit einem P-Wert < 0.05 gelten als statistisch signifikant. Verbleibende miRNAs, die nicht in das lineare Modell passten, werden mit zwei verschiedenen Methoden weiter analysiert: (1) wenn die Anzahl der Zeitpunkte <3, CDF der Normalverteilung, und (2) wenn die Anzahl der Zeitpunkte >= 3 ist, ANOVA wird verwendet.http://www.gigasciencejournal.com/content/3/1/20
Eigenschaften
- miRNA Temporaler Analysator
- Normale Quantiltransformation (NQT)
- bis zu 20 Zeitpunkte
- R-Paket
- Perl
- Heatmap
- leicht zu laufen
- grafische HTML-Oberfläche
- einfache Ausgabe
Publikum
Wissenschaftsforschung
Programmiersprache
Perl
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/mirnata/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
