Dies ist die Windows-App namens Nischennetr, deren neueste Version als v2.0.4.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens Nischennetr kostenlos mit OnWorks herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
SCREENSHOTS
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Nischennetr
BESCHREIBUNG
nischenetr: die R-Implementierung der NicheNet-Methode. Das Ziel von NicheNet ist es, die interzelluläre Kommunikation aus rechnerischer Sicht zu untersuchen. NicheNet verwendet menschliche oder Maus-Genexpressionsdaten interagierender Zellen als Eingabe und kombiniert diese mit einem früheren Modell, das vorhandenes Wissen über Ligand-zu-Ziel-Signalwege integriert. Dies ermöglicht die Vorhersage von Liganden-Rezeptor-Wechselwirkungen, die zu Veränderungen der Genexpression in interessierenden Zellen führen könnten. Dieses Modell früherer Informationen über potenzielle Ligand-Ziel-Verbindungen kann dann verwendet werden, um auf aktive Ligand-Ziel-Verbindungen zwischen interagierenden Zellen zu schließen. NicheNet priorisiert Liganden entsprechend ihrer Aktivität (dh wie gut sie beobachtete Veränderungen der Genexpression in der Empfängerzelle vorhersagen) und sucht nach betroffenen Zielen mit hohem Potenzial, durch diese priorisierten Liganden reguliert zu werden.
Eigenschaften
- NicheNet unterscheidet sich stark von den meisten aktuellen Computeransätzen zur Untersuchung der interzellulären Kommunikation
- Bewerten Sie, wie gut von einer Senderzelle exprimierte Liganden Veränderungen in der Genexpression in der Empfängerzelle vorhersagen können, indem Sie Liganden basierend auf ihrer Wirkung auf die Genexpression priorisieren
- Schließen Sie mutmaßliche Ligand-Ziel-Verbindungen ab, die im untersuchten System aktiv sind
- Validieren Sie das vorherige Ligand-Target-Modell
- Konstruktion benutzerdefinierter früherer Ligand-Target-Modelle
- Wir bieten Anleitungen zur intuitiven Visualisierung der wichtigsten Vorhersagen
Programmiersprache
R
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/nichenetr.mirror/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
