Este es el comando barrnap que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
barrnap - predicción rápida de ARN ribosómico
SINOPSIS
barrnap [opciones]
DESCRIPCIÓN
Barrnap predice la ubicación de los genes de ARN ribosómico en los genomas. Apoya las bacterias
(5S, 23S, 16S), arqueas (5S, 5.8S, 23S, 16S), mitocondrias (12S, 16S) y eucariotas
(5S, 5.8S, 28S, 18S).
OPCIONES
--ayuda Esta ayuda
--versión
Imprimir versión y salir
--citación
Imprimir cita para hacer referencia a barrnap
--Reino [X]
Reino: mito bac arc euk (predeterminado 'bac')
--tranquilo
Sin salida de pantalla (apagado predeterminado)
--hilos [NORTE]
Número de subprocesos / núcleos / CPU a usar (predeterminado '8')
--lencutoff [nn] Umbral de longitud proporcional para etiquetar como parcial (predeterminado '0.8')
--rechazar [nn]
Umbral de longitud proporcional para rechazar la predicción (predeterminado '0.5')
--valor [nn]
Corte del valor electrónico de similitud (predeterminado '1e-09')
--incseq
Incluir secuencias de entrada FASTA en la salida GFF3 (por defecto APAGADO)
Use barrnap en línea usando los servicios de onworks.net
