Este es el comando bbFilter que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
bbFilter: esto es parte del paquete mauveAligner
DESCRIPCIÓN
bbFiltro <columna vertebral archivo> <independiente dist> <salida archivo> [
... ]
El índice seq comienza en 0.
EJEMPLOS
Ejemplo:
bbFiltro my_alignment.backbone 50 my_feats.bin gp
el comando anterior extrae características binarias de "my_alignment.backbone" que son
separados por una secuencia mínima de 50 nt conservada entre todos los taxones en la alineación. los
la salida se escribe en my_feats.bin en formato genoplast
Ejemplo 2:
bbFiltro aln.backbone 100 hazañas xml bestia 0 1 2 5 6
el comando anterior extrae características binarias de "aln.backbone" que están separadas por un
mínimo de secuencia de 100 nt conservada entre los genomas 0,1,2,5, 6, XNUMX, XNUMX y XNUMX de la alineación. los
la salida se escribe en feats.xml en formato bestia
Utilice bbFilter en línea utilizando los servicios de onworks.net
