Este es el comando bp_search2BSMLp que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
search2bsml: convierta los informes analizables de SearchIO en un informe BSML
SINOPSIS
Uso:
search2bsml [-o archivo de salida] [-f formato de informe] [-i nombre de archivo de entrada] O archivo1 archivo2 ..
DESCRIPCIÓN
Este script convertirá un informe de búsqueda de proteínas (BLASTP, FASTP, SSEARCH, AXT, WABA, SIM4)
en un archivo BSML.
Las opciones son:
-i infilename - (opcional) inputfilename, leerá
ya sea archivos ARGV o de STDIN
-o nombre de archivo: el nombre del archivo de salida [STDOUT predeterminado]
-f formato - formato de resultado de búsqueda (blast, fasta, waba, axt)
(ssearch es formato rápido). por defecto es explosión.
-h - este menú de ayuda
Además, especifique los nombres de archivo que desea procesar en la línea de comandos. Si no hay archivos
se especifican, entonces se asume la entrada STDIN. Especifica esto haciendo: search2gff <file1
archivo2 archivo3
Use bp_search2BSMLp en línea usando los servicios de onworks.net
