cmtk-dwi_mask_bad_slices - Online en la nube

PROGRAMA:

NOMBRE

dwi_mask_bad_slices: encuentra cortes defectuosos en un conjunto de imágenes ponderadas por difusión.

SINOPSIS

dwi_mask_bad_slices DifusiónImagenRutas

DESCRIPCIÓN

Esta herramienta lee un conjunto de imágenes de RM ponderadas por difusión en 3D y encuentra cortes defectuosos. Una mala tajada
en una imagen de difusión se detecta como una cuya intensidad media está fuera de un determinado
intervalo alrededor de la media de las medias de todos los cortes correspondientes del resto
imágenes de difusión.

CAMPUS

Buscar Kit de herramientas Opciones (estas en compartido by todos CMTK herramientas)
--ayuda
Escriba la lista de opciones básicas de la línea de comandos en la salida estándar.

--ayudar a todo
Escriba una lista completa de opciones de línea de comandos básicas y avanzadas en la salida estándar.

--wiki
Escriba la lista de opciones de la línea de comandos en la salida estándar en el marcado de MediaWiki.

--hombre
Escriba el código fuente de la página man con el marcado 'nroff' en la salida estándar.

--versión
Escriba la versión del kit de herramientas en la salida estándar.

--eco
Escribe la línea de comando actual en la salida estándar.

- nivel de verbo
Establecer el nivel de verbosidad.

--verboso, -v
Incrementar el nivel de verbosidad en 1 (obsoleto; admitido por compatibilidad con versiones anteriores).

--hilos
Establezca el número máximo de subprocesos paralelos (para subprocesos POSIX y OpenMP).

Entrada Opciones
--b0count
Número de b = 0 imágenes al principio de la lista de imágenes. Estos no están incluidos en
la detección o enmascaramiento de cortes defectuosos, pero también se escriben en el directorio de salida para
conveniencia. Se supone que todas las imágenes b = 0 están al principio de la lista de
imágenes de entrada, pero no al final ni en el medio. [Defecto: 0]

--orientación de las rebanadas
Defina la orientación del corte de las imágenes de difusión. Valores admitidos: "axial",
"sagital", "coronal", "corte-x", "corte-y", "corte-z", donde el valor predeterminado es "axial",
o utilice uno de los siguientes:

--axial
Cortes axiales [Esta is las defecto]

--sagital
Cortes sagitales

--coronal
Cortes coronales

- rebanada-x
El eje de coordenadas X es la dirección de corte

- rebanada-y
El eje de coordenadas Y es la dirección del corte

- rebanada-z
El eje de coordenadas Z es la dirección de corte [Esta is las defecto]

Malo Rebanada Detección
--stdev
Umbral para la identificación de cortes defectuosos en unidades de desviaciones estándar de intensidad sobre
todos los cortes correspondientes de las imágenes de difusión restantes. [Defecto: 3]

Salida Opciones
--convertir a
Tipo de datos escalares para las imágenes de salida. Si su valor de relleno es negativo pero su
datos de entrada sin firmar, por ejemplo, asegúrese de seleccionar un tipo de datos firmado para el
producción. De forma predeterminada, el tipo de datos de salida es el mismo que el tipo de entrada. Soportado
valores: "char", "byte", "short", "ushort", "int", "uint", "float", "double" o use
uno de los siguientes:

--carbonizarse
8 bits, firmado

--byte
8 bits, sin firmar

--pequeño
16 bits, firmado

--corto
16 bits, sin firmar

--En t
32 bits firmados

--uint
32 bits sin firmar

--flotador
Punto flotante de 32 bits

--doble
Punto flotante de 64 bits

--valor de relleno , -p
Valor de relleno para reemplazar los datos de los cortes defectuosos detectados en las imágenes de salida. [Defecto: -dieciséis]

--directorio de salida , -o
Ruta del sistema de archivos para escribir imágenes con cortes defectuosos enmascarados (es decir, rellenos con un
valor de relleno). [Defecto: NINGUNO]

AUTORES

Torsten Rohlfing, con contribuciones de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff y Yaroslav Halchenko

Use cmtk-dwi_mask_bad_slices en línea usando los servicios de onworks.net