Este es el comando createChemistryHeader que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
createChemistryHeader.py: crea un encabezado SAM con la química de secuenciación PacBio
práctica
DESCRIPCIÓN
uso: getChemistryHeader.py [-h] [--debug] --bas_files BAS_FILES
[BAS_ARCHIVOS...]
archivo_de_alineación_de_entrada archivo_de_encabezado_de_salida
createChemistryHeader crea un encabezado SAM que contiene la información química utilizada por
Carcaj.
posicional argumentos:
archivo_de_alineación_de_entrada
Un archivo SAM o BAM producido por BLASR.
archivo_encabezado_de_salida
Nombre del archivo de encabezado SAM o BAM que se creará con información química
cargado
opcional argumentos:
-h, --ayuda
mostrar este mensaje de ayuda y salir
--depurar
Genere información de registro detallada. (predeterminado: falso)
--bas_files ARCHIVOS_BAS [ARCHIVOS_BAS...]
Los archivos bas o bax que contienen las lecturas que se alinearon en el
input_alignment_file. También puede ser un archivo de archivos bas o bax. (predeterminado: Ninguno)
Utilice createChemistryHeader en línea utilizando los servicios de onworks.net
