Este es el comando edialigne que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
edialign - Alineación local múltiple de secuencias
SINOPSIS
edialinear -secuencias conjunto de secuencias -modo nuc lista -revcomp booleano [superposición selección]
[-enlace lista] [-maxfragl entero] -fragmento booleano -fragsim entero
[-su puntaje booleano] [-umbral flotar] -máscara booleano -dos estrellas booleano
-starnum entero -archivo de salida archivar -outseq Seqoutall
edialinear -ayuda
DESCRIPCIÓN
edialinear es un programa de línea de comandos de EMBOSS (“European Molecular Biology Open
Paquete de programas"). Es parte del grupo (s) de comando "Alineación: Múltiple".
CAMPUS
Entrada .
-secuencias conjunto de secuencias
Adicionales .
-modo nuc lista
Modo de alineación de secuencia de ácido nucleico (simple, traducido o mixto) Valor predeterminado: n
-revcomp booleano
Valor predeterminado: N
superposición selección
Por defecto, los pesos de superposición se utilizan cuando Nseq = <35, pero puede configurarlo en 'sí' o
'no' Valor predeterminado: predeterminado (cuando Nseq = <35)
-enlace lista
Método de agrupamiento para construir el árbol de secuencia (UPGMA, enlace mínimo o máximo
enlace) Valor predeterminado: UPGMA
-maxfragl entero
Valor predeterminado: 40
-fragmento booleano
Valor predeterminado: N
-fragsim entero
Valor predeterminado: 4
-su puntaje booleano
Valor predeterminado: N
-umbral flotar
Valor predeterminado: 0.0
Salida .
-máscara booleano
Valor predeterminado: N
-dos estrellas booleano
Valor predeterminado: N
-starnum entero
Valor predeterminado: 4
-archivo de salida archivar
-outseq Seqoutall
Utilice edialigne en línea utilizando los servicios de onworks.net
